本能寺の変後、豊臣秀吉が正親町親王の勅許を得て、船岡山を織田信長の霊地と定めたことがはじまりとされています。神社は、1869年に明治天皇の命によって織田信長を祭神に創建され、”建勲”の名はこの時賜りました。正式名称は「たけいさおじんじゃ」ですが、一般には「けんくんじんじゃ」と呼ばれています。
　1880年には信長の子・信忠も配祀されました。