桓武天皇が、身辺の不幸や洛中に疫病をもたらす早良親王らの怨霊を鎮めるために創祀したと伝わる、京都でも古い歴史をもつ神社です。古来より疫病除けの霊社として信仰を集め、毎年5月に御霊祭が行われます。
　また境内の「御霊の森」は応仁の乱の先端が開かれたところとしても知られ、「応仁の乱発祥の地」碑が立っています。